Материал гель электрофорезімен бөлінгеннен кейін ДНК-ны көруге және суретке түсіру үшін қолдануға болатын бірнеше түрлі дақтар бар. Көптеген таңдаулардың ішінде осы бес штамдар ең кең таралған болып табылатын Британ Эдидоммен жиі кездесетін бастама болып табылады. Бұл үдерісте жұмыс істегенде, штамдар арасындағы айырмашылықты біліп қана қоймай, денсаулығы үшін тән тәуекелдерді білу маңызды.
01 Эдитиум Бромид
Эпидиум бромды ДНК-ны визуализациялау үшін қолданылатын ең танымал бояғыш болып табылады. Бұл бояғыш гель қоспасында, электрофорез буферінде немесе ол іске қосылғаннан кейінгі гельді бояуға болады. Бояғыштың молекулалары ультракүлгін сәулесіндегі ДНҚ-ның флорасы мен флуоресцентіне ұқсайды, бұл топтар гельдің қай жерде екендігін көрсетеді. Өзінің артықшылықтарына қарамастан, төмендеуі этидиум бромды әлеуетті канцероген болып табылады, сондықтан ол өте мұқият өңделуі керек. Осы гельмен жұмыс істеудің денсаулыққа байланысты ықтимал қауіптеріне байланысты баламалар табылды. 02 SYBR Gold
SYBR Gold бояуы екі немесе бір реттік ДНК бояйру үшін немесе РНҚ дауға болады. SYBR Gold компаниясы этидиум бромидінің нарыққа шығуы үшін алғашқы альтернативалардың бірі болып табылады және ол этидиом бромидіне қарағанда аса сезімтал болып саналады. Нуклеин қышқылдарына байланыстырылғаннан кейін бояғыш 1000 форматта ультрафиолет флуоресценциясын көрсетеді. Содан кейін қалың және жоғары пайыздық агароздық гельге еніп, формальдегидті гельдерде қолдануға болады. Байланыстырылмаған молекуланың флуоресценциясы соншалықты төмен болғандықтан, тағайындау талап етілмейді. Лицензия иесі Молекулярлы Проблемалар (SYBR Gold іске қосылған сәттен бастап) EIII bromide үшін қауіпсіз балама болып табылатын SYBR Safe және SYBR Green әзірлеп, сатады.
03 SYBR Жасыл
SYBR Green I және II дақтары (тағы да, молекулярлық пробелілер арқылы сатылатын) түрлі мақсаттар үшін оңтайландырылған. Олар ДНҚ-мен байланыстырылғандықтан, олар әлі де ықтимал мутагендер болып саналады және осыған байланысты оларға қамқорлық жасау керек. SYBR Green I, екі жақты ДНҚ-мен пайдалану үшін аса сезімтал, ал SYBR Green II, бір жақты ДНҚ немесе РНҚ-мен пайдалану үшін жақсы. Танымал этидиум Бромид сияқты дақтары сияқты, жоғары сезімтал дақтар УК сәулесінен әсер етеді. 04 SYBR Қауіпсіз
SYBR қауіпсізі Ethidium Bromide және басқа SYBR дақтарына қауіпсіз балама болу үшін жасалған. Ол қауіпті қалдықтар болып саналмайды және әдеттегі кәріз жүйелері арқылы (яғни ағынды сорып алу) жойылуы мүмкін, себебі уыттылықты сынау өткір уыттылық жоқ екенін көрсетеді. Тестілеу сонымен қатар Сирия Хамстын Эмбрионы (SHE) жасушалары, адамның лимфоциттері, тышқандар лимфомасы клеткалары және АМЕС тестінде аз немесе ешқандай генотоксич болмайтынын көрсетеді. Дақтарды көмескі жарық траниллилинатормен қолдануға болады, ол ДНҚ-ға аз зиян келтіреді және кейінірек клондау үшін тиімдірек болады. 05 Эва Грин
Эва Грин жасыл флуоресцентті бояғыш болып табылады, ол басқа да бояғыштарға қарағанда ПТР ингибируетінде табылған. Бұл сандық нақты уақыттық ПТР сияқты қосымшалар үшін өте пайдалы етеді. ДНҚ қалпына келтіру үшін төменгі балқыту нүктелерінің гельдерін қолдансаңыз, бұл жақсы таңдау. Жоғары температурада өте тұрақты және өте төмен флуоресценцияға ие, бірақ ДНК-мен байланысқан кезде жоғары флуоресцентті болады. Эва Грин де цитотоксичность немесе мутагенділік өте төмен немесе жоқ екендігін көрсетті.